Bioinformatique sous Linux
Bioinformatique générale
Les modules Biopython et Bioperl regroupent un ensemble de bibliothèques pour les langages python et perl. Ces modules proposent des outils variés tels que l'interaction avec des bases de données biologiques publiques, la manipulation, l'annotation de séquences…
Biologie moléculaire / Génétique
Manipulation de séquences biologiques
Alignements de séqences
Le paquet apt://blast2 permet d'installer en local la célèbre suite d'outils développée par le NCBI.
design d'oligonucléotides
Le logiciel primer3 (apt://primer3, http://frodo.wi.mit.edu/primer3/) permet le design d'oligonucléotides en prenant en compte de multiples critères (%GC, autocomplémentarité, taille de fragment…).